摘要
清宮文物，主要是我國歷代宮廷的舊藏，故宮博物院即由清宮遞嬗而來。民國六年（1917）七月，張勳復辟，破壞國體，違反優待條件。民國十三年（1924）十一月五日，攝政內閣總理黃郛代表民意，修正皇室優待條件，廢除皇帝尊號，溥儀即日遷出紫禁城，並交出國璽及各皇宮。國務院成立辦理清室善後委員會，以接收清宮，敦聘李煜瀛為委員長。李煜瀛，字石曾，早年赴法留學，並加入革命黨，他深悉巴黎羅浮宮（Louvre）為昔日法國王宮，大革命後改成博物館，返國後即倡議改清宮為博物院，以利中外人士的參觀。同年十一月二十日，李煜瀛正式就職任事，辦理清室善後委員會開始分組點查清宮物品。民國十四年（1925）九月二十九日，因點查工作將次告竣，為遵照組織條例的規定，並執行攝政內閣的命令，辦理清室善後委員會乃籌備成立故宮博物院。同年十月十日雙十節，在清宮乾清門內舉行開幕典禮，北平故宮博物院正式成立。
北平故宮博物院的成立，不僅成為中外人士參觀遊覽之所，其有裨於歷代文物的保全，更是功不可沒。北平故宮博物院成立後，即在圖書館下設文獻部，以南三所為辦公處，開始集中宮內各處檔案。民國十四年（1925）十二月，提取東華門外宗人府玉牒及檔案存放寧壽門外東西院。民國十五年（1926）一月，北平故宮博物院向國務院接收清代軍機處檔案，移存大高殿。同年二月，著手整理軍機處檔案。八月，提取內務府檔案，存放南三所。民國十六年（1927）十一月，改文獻部為掌故部。民國十七年（1928）六月，掌故部接收東華門內清史館。民國十八年（1929）三月，改掌故部為文獻館。同年八月，著手整理宮中懋勤殿檔案及內務府檔案。九月，接收清代刑部檔案，移存大高殿。十月，清史館檔案移存南三所。十一月，清史館起居注冊稿本移存南三所。十二月，著手整理清史館檔案；壽皇殿方略移存大高殿。民國十九年（1930）三月，提取實錄庫所存漢文實錄及起居注冊，移存大高殿。同年六月，清理皇史宬實錄。八月，整理乾清宮實錄。民國二十年（1931）一月，著手整理內閣大庫檔案。
九一八事變後，華北局勢動盪不安，為謀文物的安全，北平故宮博物院決定南遷。民國二十一年（1932）八月，文獻館所保存的各種檔案物件，開始裝箱編號。十一月，北平故宮博物院改隸行政院。民國二十二年（1933）二月六日起，文物分批南遷上海。民國二十三年（1934）十月二日，公佈修正國立北平故宮博物院組織條例。民國二十五年（1936）八月，南京朝天宮庫房落成。十二月八日，文物由上海再遷南京朝天宮。七七事變發生後，文物流散後方，分存川黔各地。抗戰勝利後，文物由後方運回南京。
民國三十七年（1948）十二月，徐蚌戰事吃緊，北平故宮博物院與南京中央博物館籌備處決議甄選文物精品，分批遷運臺灣。民國三十八年（1949），遷臺文物存放於臺中北溝。同年八月，北平故宮博物院、中央博物院籌備處等單位合併組織聯合管理處。民國四十四年（1955）十一月，改組為國立故宮中央博物院聯合管理處。民國五十年（1961），行政院在臺北市郊士林外雙溪為兩院建築新廈。民國五十四年（1965）八月，新廈落成，行政院公佈國立故宮博物院管理委員會臨時組織規程，明定設立國立故宮博物院，將中央博物館籌備處文物，暫交國立故宮博物院保管使用。新址為紀念孫中山先生百歲誕辰，又稱中山博物院。同年十一月十二日，正式開幕。
民國三十八年（1949）一月，大陸文管會接收北平故宮博物院，以後改稱北京故宮博物院。民國四十年（1951）五月，文獻館改稱檔案館，將原管圖案、輿圖、冠服、樂器、兵器等移交北京故宮博物院保管部，從此，檔案館成為專門的明清檔案機構。民國四十四年（1955）十二月，檔案館移交檔案局，改稱第一歷史檔案館。民國四十七年（1958）六月，第一歷史檔案館改名為明清檔案館。民國四十八年（1959）十月，明清檔案館併入中央檔案館，改稱明清檔案部。民國六十九年（1980）四月，明清檔案部由國家檔案局接收，改稱中國第一歷史檔案館。
北平故宮博物院原藏明清檔案，從民國三十八年（1949）以後，分存海峽兩岸。北平故宮博物院文獻館南遷的明清檔案，共計3773箱，其中遷運來臺，現由國立故宮博物院典藏者，計204箱，共約四十萬件冊。北京中國第一歷史檔案館現藏明清檔案，共74個全宗，一千餘萬件。 其中明代檔案只有三千多件，以清代檔案佔絕大多數。從時間上看，包括滿洲入關前明神宗萬曆三十五年（1607）至入主中原清朝末年宣統三年（1911），此外還有溥儀退位後至民國二十九年（1940）的檔案。從所屬全宗看，有中央國家機關的檔案，有管理皇族和宮廷事務機關的檔案，有軍事機構的檔案，有地方機關的檔案，也有個人全宗的檔案。從檔案種類和名稱來看，其上行文書、下行文書、平行文書及特定用途的文書包括：制、詔、誥、敕書、題、奏、表、箋、咨、移、札、片、呈、稟、照、單、函、電、圖、冊等等。從文字上看，絕大部分是漢文檔案，其次是滿文及滿漢合璧檔案，此外也有少量的外交檔案及少數民族文字檔案。
臺北國立故宮博物院現藏清代檔案，按照清宮當年存放的地點，大致可以分為《宮中檔》、《軍機處檔》、《內閣部院檔》、《史館檔》及各項雜檔等五大類。從時間上看，包括明神宗萬曆三十五年（1607）至清宣統三年（1911）的清朝官方檔案，此外還有少量宣統十六年（1924）的檔案。從文字上看，絕大部分是漢文檔案，其次是滿文檔案，此外也含有少量藏文、蒙文、回文等少數民族文字檔案。從文書的性質看，有上行文書、下行文書、平行文書等，亦可謂品類繁多。
《宮中檔》的內容，主要是清代歷朝君主親手御批及軍機大臣奉旨代批的奏摺及其附件。此外，諭旨的數量，亦相當可觀。從時間上看，主要包括康熙朝中葉至宣統末年。按照書寫文字的不同，可以分為漢文奏摺、滿文奏摺及滿漢合璧奏摺。清初本章，沿襲明代舊制，公事用題本，私事用奏本，公題私奏，相輔而行。康熙年間採行的奏摺是由明代奏本因革損益而來的一種新文書。定例，督撫等題奏本章均須投送通政使司轉遞內閣，奏摺則徑呈御覽，直達天聽，不經通政使司轉遞。奏本與題本的主要區別，是在於文書內容的公私問題，奏摺則相對於傳統例行文書的缺乏效率及不能保密而言，不在內容公私的區別。凡涉及機密事件，或多所顧忌，或有滋擾更張之請，或有不便顯言之處，或慮獲風聞不實之咎等等，俱在摺奏之列。奏摺在採行之初，一方面可以說是皇帝刺探外事的工具，一方面則為文武大臣向皇帝密陳聞見的文書。臣工進呈御覽的奏摺，以硃筆批諭發還原奏人。皇帝守喪期間，改用墨批。同治皇帝、光緒皇帝都以沖齡即位，他們親政以前，都由軍機大臣奉旨以墨筆代批，而於守喪期間，改用藍批。因御批奏摺，以硃批者居多，所以習稱硃批奏摺。康熙皇帝在位期間，奏摺奉御批發還原奏人後，尚無繳回內廷的規定。雍正皇帝即位以後，始命內外臣工將御批奏摺查收呈繳，嗣後繳批遂成定例。御批奏摺繳還宮中後，貯存於懋勤殿等處，因這批檔案原先存放於宮中，所以習稱為《宮中檔》。
軍機處開始設立的名稱叫做軍需房，是由戶部分設的附屬機構，其正式設立的開始時間是在雍正七年（1729）。其後，名稱屢易，或稱軍需處，或稱辦理軍需處。雍正十年（1732）辦理軍機事務印信頒行後，因印信使用日久，遂稱辦理軍機事務處，習稱辦理軍機處，簡稱軍機處。雍正十三年（1735）八月二十二日，雍正皇帝崩殂，乾隆皇帝繼承大統，以總理事務王大臣輔政。同年十月二十九日，乾隆皇帝以西北兩路大軍已經撤回，故諭令裁撤辦理軍機處，總理事務處遂取代了辦理軍機處。由於準噶爾的威脅並未解除，軍務尚未完竣，軍機事務仍需專人辦理。乾隆二年（1737）十一月，因莊親王允祿等奏辭總理事務，乾隆皇帝即下令恢復辦理軍機處的建置，並換鑄銀印。軍機大臣以內閣大學士及各部尚書、侍郎在辦理軍機處辦事或行走，而逐漸吸收了內閣或部院的職權，其職掌範圍日益擴大，它不僅掌戎略，舉凡軍國大計，莫不總攬，逐漸取代了內閣的職權，國家威命所寄，不在內閣，而在辦理軍機處。國立故宮博物院現藏《軍機處檔》，主要分為月摺包和檔冊兩大類。月摺包主要為《宮中檔》奏摺錄副存查的抄件及原摺的附件如清單、圖冊等等，其未奉御批的部院衙門奏摺，或代奏各摺，則以原摺歸檔，俱按月分包儲存，稱為月摺包。國立故宮博物院現藏月摺包始自乾隆十一年（1746）十一月，迄宣統二年（1910）七月。除月摺包外，各種檔冊的數量，亦相當可觀。依照現藏檔冊的性質，大致可以分為目錄類、諭旨類、專案類、奏事類、記事類、電報類等六大類，主要為軍機處分類彙抄經辦文移的檔冊。
皇太極在位期間，積極倣效明朝政治制度。天聰三年（1629）四月，設立文館，命儒臣翻譯漢字書籍，並記注滿洲政事。天聰五年（1631）七月，設吏、戶、禮、兵、刑、工六部。天聰十年（1636）三月，改文館為內國史、內秘書、內弘文三院，各置大學士、承政、理事官等員。順治十五年（1658）七月，內三院更名內閣，其大學士加殿閣大學士，別置翰林院，軍國機要，綜歸內閣。自從雍正年間設立辦理軍機處後，內閣權力雖然漸為辦理軍機處所奪，但它承辦例行刑名等政務的工作，並未輕減，所保存的文獻檔案，亦極可觀。徐中舒撰〈內閣檔案之由來及其整理〉一文已指出，「清代內閣在雍乾以前為國家庶政所自出之地，在雍乾以後猶為制誥典冊之府，所存檔案，都是當時構成史蹟者自身的敘述。雖不免帶些官家的誇張，究竟還是第一等的史料。」國立故宮博物院現藏內閣部院檔，大致可以分為五大類：第一類，是內閣承宣的文書，如詔書、敕書、誥命等；第二類，是帝王言動國家庶政的當時記載，如起居注冊、六科史書等；第三類，是官修書籍及其文件，如滿漢文實錄等；第四類，是內閣日行公事的檔冊，如上諭簿、絲綸簿、外紀簿等；第五類，是盛京移至北京的舊檔，如滿文原檔等，各類檔案都可說是直接史料。
史館檔包括清朝國史館及民國初年清史館的檔案。清代的國史館，設在東華門內，成為常設修史機構，附屬於翰林院。民國三年（1914），國務院呈請設立清史館，以修清史。史館檔的內容，主要為紀、志、表、傳的各種稿本及其相關資料。
清代檔案的整理出版，早在清代就已開始。雍正十年（1732），雍正皇帝特檢歷年批發的奏摺，命內廷詞臣繕錄校理，付諸剞劂，彙成數帙，即頒賜在廷群臣及外任文武臣工。惟工未告竣，雍正皇帝已崩殂。乾隆皇帝即位後，就雍正皇帝檢錄已定的御批奏摺，彙著為目，於乾隆三年（1738）、刊印成書，計十八函，共一百一十二冊，冠以雍正皇帝硃筆特諭，殿以乾隆皇帝後序，稱《世宗憲皇帝硃批諭旨》，簡稱《硃批諭旨》，其內容主要是雍正朝外任官員二百二十三人繳還宮中的硃批奏摺、硃批旨意及硃筆特諭。《硃批諭旨》所選刻的奏摺，不過佔雍正朝奏摺總數的十之二、三而已。且其所刊奏摺，不僅格式與原摺有出入，奏摺內容亦經刪略，硃批旨意，尤多潤飾，而相對減低其史料價值。北平故宮博物院成立後，文獻館先後出版《史料旬刊》、《文獻叢編》、《掌故叢編》、《清代文字獄檔》、《掌故拾零》、《清太祖武皇帝實錄》等書。民國五十四年（1965），國立故宮博物院在臺北正式恢復建置以來，即積極進行檔案的整理工作。首先著手《宮中檔》的整理編目工作，將奏摺按具奏年月日的順序編排，在原摺尾幅背面鈐蓋登錄號碼，此即件數號碼。編號既定，然後摘錄事由，填明年月日及具摺人官職姓名，先填草卡，經核校後，再繕正卡，並編製具奏人姓名索引及分類索引。《宮中檔》編目工作告竣後，又賡續軍機處月摺包的編目工作，以奉硃批日期的順序排列，亦在每件尾幅背面鈐蓋登錄號碼，亦即件數號碼，先編草卡，再繕正卡，除登錄硃批年月日、官銜、姓名及事由外，另填明原摺具奏年月日、以便查檢原摺，並編製具奏人姓名索引。至於檔冊的編目，則按編年體分類編目。為便於提件繙檢各類檔案，國立故宮博物院另編輯出版《國立故宮博物院清代文獻檔案總目》、《國立故宮博物院藏清代文獻傳包傳稿人名索引》各一冊，標列檔冊名稱，現存年月及冊數。《史館檔》傳包、傳稿，亦標明姓名及編號，便於借閱提件。為便利中外學人的研究，國立故宮博物院計畫將院藏清代檔案陸續影印出版。民國五十八年（1969）八月，出版《舊滿洲檔》十巨冊。民國五十九年（1970）七月，出版《清太祖武皇帝實錄》四卷。同年十月，出版《袁世凱奏摺專輯》八冊。民國六十年（1971）十二月，出版《年羹堯奏摺專輯》三冊。民國六十二年（1973）六月起出版《宮中檔光緒朝奏摺》二十六輯。民國六十五年（1976）六月起出版《宮中檔康熙朝奏摺》九輯。民國六十六年（1977）十一月起出版《宮中檔雍正朝奏摺》三十二輯。民國七十一年（1982）五月起出版《宮中檔乾隆朝奏摺》七十五輯。民國八十二年（1993）十一月，出版《先正曾國藩文獻彙編》八冊。民國八十三年（1994）十月，出版《清宮月摺檔臺灣史料》八冊。民國八十五年（1996）十月，出版《清宮諭旨檔臺灣史料》六冊。民國八十七年（1998）十月，出版《清宮廷寄檔臺灣史料》三冊。各輯俱將諭旨、奏摺、清單等按照年月日先後編次影印出版，分冠簡目，標明日期，具奏人官銜姓名及事由，頗便於查閱。為便於中外學人了解現藏檔案概況，又先後出版《故宮檔案述要》、《故宮臺灣史料概述》等指南性質的專書。近數十年來，海內外學人利用國立故宮博物院現藏檔案撰寫完成的專書及論文學，已指不勝屈。展望未來，必將有更豐碩的研究成果。